Ekipa prowadzi dochodzenie w sprawie śmierci technika marynarki wojennej. Jego ciało zostało znalezione dryfujące w jeziorze w pobliżu miejsca, gdzie ma miejsce popularna impreza plenerowa. Córka Sloane, Faith, zaskakuje matkę niespodziewaną prośbą.
U wybrzeży Bahamów morze wyrzuca na brzeg ciało marynarza. Okazuje się, że jest to 19-letni członek załogi statku USS Foster - Russell MacDonald. Gibbs znajduje w rzeczach Russela książkę o sztuce walki mieczem.
Trzej amerykańscy marynarze spędzają wolny czas w barze w hiszpańskim porcie. Nagle podoficer Wilkes zaczyna dziwnie się zachowywać. Objawy świadczą o zażywaniu metaamfetaminy. Wilkes umiera. Padł ofiarą morderstwa.
Agentka Kate Todd nadzoruje w samolocie Air Force One pracę oficera marynarki Raya Trappa, który od niedawna ochrania głowę państwa. Podczas lotu oficer zostaje zaproszony przez prezydenta na lunch. Tuż po posiłku umiera.
Gibbs, Tony i Kate udają się na Kubę, gdzie rozpoczynają dochodzenie. Podoficer marynarki wojennej Khalil Said zmarł po połknięciu szmaragdów. Według agentów chciał je przemycić z bazy wojskowej w Guantanamo.
Oficerowie piechoty morskiej Kidwell i Peary zmarli w niewyjaśnionych okolicznościach. Ich żony Sarah i Lisa otrzymały zaplombowane trumny. Po pogrzebie do Sarah dzwoni mężczyzna, który twierdzi, że jest jej mężem.
Kobieta, która została pochowana żywa, wydostaje się z grobu. Nie pamięta, kim jest, ale wie, że na statku marynarki wojennej ma wkrótce wybuchnąć bomba. Agenci rozpoczynają śledztwo i znajdują martwego Richtera.
Analityk CIA staje się świadkiem morderstwa. Na miejsce przybywa Gibbs ze swoim zespołem. Znajdują ciało porucznika Thomasa Egana. Okazuje się, że w dniu śmierci Egan miał testować nowy model sonaru, które zniknął.
Charakterystyczny tatuaż wskazuje, że zwłoki należą do żołnierza marynarki. Śledztwo prowadzi detektywów do zmarłego przed dwoma laty na zawał Thomasa Dorna. Podejrzaną o zabójstwo staje się jego siostra, która otrzymała wysokie odszkodowanie.
Sierżant Alvarez ginie od kuli snajpera w trakcie rozmowy rekrutacyjnej. W sąsiednim stanie dochodzi do podobnego zabójstwa, w którym ofiarą jest również oficer marynarki wojennej zajmujący się rekrutacją.
Porucznik marynarki wojennej Wayne Julius zostaje zastrzelony na poboczu drogi. Agenci służb śledczych wszczynają dochodzenie. Szeryf Dupray przypomina sobie podobne morderstwo, po którym został dowód w postaci DNA mordercy.
Gibbs dowiaduje się, że jego były dowódca, pułkownik Ryan, zdezerterował z bazy w Iraku. Jest podejrzany o zabójstwo żołnierza i przywłaszczenie pieniędzy Husajna. Agent wierzy w niewinność Ryana. Podejrzewa spisek.
Ducky i Gerald zostają wezwani do przeprowadzenia sekcji. Jednak z worka na zwłoki wychodzi mężczyzna z pistoletem i bierze ich jako zakładników. Chce zobaczyć ciało ofiary ostatniej strzelaniny - terrorysty Qassama.